第二次世界大战前夕,一名一般的陆军士兵(龟梨和也 饰)因关心同伴而殴打长官,随后被军事法庭判处死刑。关键时刻,名叫结城(伊势谷友介 饰)的奇妙男子突然出现,并将之吸纳进专门培养间谍的隐秘部门——D机关。历经层层考验,青年终于得到第一项任务。不久前某犹太科学家遭到暗杀,而他记载着最新式武器设计图的黑色笔记据讲落入美国大使埃内斯特·格雷厄姆(Richard Moss 饰)手中。青年化名嘉藤次郎来到了被称为魔都的都市,伺机盗出笔记。与此同时,英、苏、德等国的特工也闻风而动,顶峰的间谍大战立即展开…… 本片依照柳广司的同名系列小讲改编。